造成膜污染主要原因有两个：膜表面吸附溶质形成的膜污染与浓差极化的影响。膜污染是指处理物料中的微粒、胶体颗粒以及溶质大分子由于与膜存在物理、化学或机械作用而引起的在膜表面或膜孔内吸附和沉积造成膜孔径变小或堵塞，使膜通量及膜的分离特性产生变化的现象。组分在膜孔中沉积将造成膜孔的减小乃至堵塞。对膜污染而言，往往具有不可逆性。而浓差极化则是膜表面局部浓度增加引起边界层流体阻力增加，导致传质推动力下降的现象。这种影响具有可逆性，可通过降低料液浓度或改善膜面附近料液侧的流体力学条件如提高流速、采用湍流促进器和设计合理的流道结构等方法来减小浓差极化的影响。对膜孔径的选择，不能简单认为在能够满足截留效果的前提下应尽量选择较大孔径的膜，应根据所处理物料的特点及所要达到的截留率来确定。对较大孔径的膜，尽管其初始通量较大，但通量衰减较快，易受到膜污染。因此对膜孔径的选择应比要求截留的分子质量要小，这样能获得较好的处理效果，还可减少溶质在膜孔上的吸附和堵塞所造成的污染。因此实际操作过程中还要综合考虑两者的关系，通过实验来确定合适的膜孔径。